Video: BAM indeks faylı nədir?
2024 Müəllif: Lynn Donovan | [email protected]. Son dəyişdirildi: 2023-12-15 23:43
A BAM faylı (. bam ) SAM-ın ikili versiyasıdır fayl . SAM fayl (. sam) nişanla ayrılmış mətndir fayl ardıcıllıqla düzülmə məlumatlarını ehtiva edir. İndeksləmə : IGV tələb edir ki, həm SAM, həm də BAM faylları mövqeyə görə sıralansın və indeksləşdirilmiş , və bu indeks faylları xüsusi adlandırma konvensiyasına əməl edin.
Eynilə insanlar soruşurlar ki, mən BAM faylını necə aça bilərəm?
Etibarən Fayl menyu seçin Açıq və seçin BAM faylları sol tərəfdən. Əlavə et deyən sağdakı düyməni seçin BAM faylı . -a keçin BAM Test Fayllar endirdiyiniz qovluğu ilə_index_with_graph seçin. basın Açıq , xəritə seçin.
İkincisi, BAM faylını Fastq-a necə çevirə bilərəm? Aşağıda BAM Faylını FASTQ formatına çevirmək üçün addımlar verilmişdir. Bu, Linux-da işləyəcək və SAMTOOLS və BEDTOOLS tələb edəcək
- SAMTOOLS-u yükləyin.
- Command tar xzvf samtools-version.tar.bz2 istifadə edərək çıxarış.
- O, samtools-version adı ilə bir qovluq yaradacaq.
- CD samtools-versiya qovluğuna keçin.
Eynilə, BAM faylını SAM faylına necə çevirə bilərəm?
Kimə SAM çevirmək üçün BAM , biz samtools view əmrindən istifadə edirik. Girişimizin daxil olduğunu qeyd etməliyik SAM formatı (defolt olaraq gözləyir BAM ) -S seçimindən istifadə etməklə. Çıxışın olmasını istədiyimizi də söyləməliyik BAM (standart olaraq istehsal edir BAM ) -b seçimi ilə.
Samtools görünüşü nə edir?
Samtools BAM formatında düzülmələri manipulyasiya edən köməkçi proqramlar toplusudur. SAM (Sequence Alignment/Map) formatından idxal və ixrac edir, edir çeşidləmə, birləşmə və indeksləşdirmə və istənilən bölgədə oxunuşları sürətlə əldə etməyə imkan verir. Samtools axın üzərində işləmək üçün nəzərdə tutulmuşdur.
Tövsiyə:
Test faylı nədir?
TEST faylı nədir? TEST fayl növü ilk növbədə Apple II əməliyyat sistemi ilə əlaqələndirilir
C++-da təsadüfi giriş faylı nədir?
C-də Təsadüfi Fayl Girişi Əvvəlki dərslərimizdə faylı açmağı, faylı bağlamaq, fayldan oxumaq və fayla yazmağı öyrənmişdik. Həm də öyrəndik ki, iki növ fayl var, ikili fayllar və mətn faylları. Təsadüfi fayl girişi o deməkdir ki, oxumaq və ya yazmaq üçün fayl göstəricisini faylın istənilən hissəsinə apara bilərsiniz
Kript faylı nədir?
CRYPT faylı məşhur smartfon mesajlaşma proqramı olan WhatsApp Messenger tərəfindən yaradılmış şifrələnmiş fayldır. O, WhatsApp proqramından ehtiyat nüsxəsini çıxaran mesajların arxivini ehtiva edir. Əgər ehtiyat nüsxəsini yaratmaq üçün istifadə etdiyiniz eyni Google hesabı ilə daxil olsanız, WhatsApp saxladığınız CRYPT fayllarınızı deşifrə edə bilər
Mətn faylı adında iki ümumi mətn faylı ayırıcısında ayırıcıların məqsədi nədir?
Ayrılmış mətn faylı məlumatların saxlanması üçün istifadə edilən mətn faylıdır, burada hər bir sətir bir kitabı, şirkəti və ya başqa bir şeyi təmsil edir və hər bir sətirdə ayırıcı ilə ayrılmış sahələr vardır
SQL-də indeks və indeks yaratmaq nədir?
SQL CREATE INDEX bəyanatı. CREATE INDEX ifadəsi cədvəllərdə indekslər yaratmaq üçün istifadə olunur. İndekslər verilənlər bazasından məlumatları başqa vaxta nisbətən daha tez əldə etmək üçün istifadə olunur. Qeyd: İndeksləri olan cədvəli yeniləmək, cədvəlsiz yeniləməkdən daha çox vaxt aparır (çünki indekslərin də yeniləməyə ehtiyacı var)